Chu kỳ đáp ứng tình dục của con người đặt nền tảng cho việc nghiên cứu và phân loại các rối loạn chức năng tình dục ở nam và nữ.[28][29] Có bốn loại rối loạn chức năng tình dục chính: rối loạn ham muốn, rối loạn hưng phấn, rối loạn cực khoái và rối loạn đau tình dục. Chúng vẫn được phân loại như vậy trong DSM-IV-TR. Tuy nhiên, nghiên cứu gần đây cho thấy mô hình đáp ứng tình dục hiện tại cần được sửa đổi để điều trị tốt hơn các rối loạn chức năng này. Một lý do là có sự chồng chéo đáng kể giữa các rối loạn chức năng tình dục ở phụ nữ.[30] Một nghiên cứu cho thấy ở những bệnh nhân mắc chứng rối loạn ham muốn tình dục kém hoạt động (HSDD), 41% phụ nữ có ít nhất một rối loạn chức năng tình dục khác và 18% đã chẩn đoán ở cả ba loại (nghĩa là rối loạn ham muốn, kích thích và cực khoái).[31]

Một vấn đề khác là, giữa phụ nữ, có sự khác biệt giữa ham muốn và hưng phấn. Sau khi Cynthia Graham đánh giá nghiêm trọng chứng rối loạn hưng phấn tình dục nữ (FSAD), cô phát hiện ra rằng phụ nữ báo cáo rằng, trái với mô hình của Masters và Johnson, hưng phấn tình dục đôi khi có trước ham muốn tình dục; tại thời điểm khác, mong muốn được trình bày trước khi kích thích.[32] Do tỷ lệ độ hấp thụ cao giữa HSDĐ và FSAD, cô muốn hợp nhất chúng để tạo ra danh mục "Rối loạn tình dục / Rối loạn tình dục". Hartmann và các đồng nghiệp tóm tắt quan điểm của họ về mô hình hiện tại của chu kỳ đáp ứng tình dục và kết luận rằng "bằng cách đơn giản mở rộng và tiếp tục các tiêu chí DSM-IV và các hệ thống phân loại chu kỳ phản ứng truyền thống, không thể đưa ra các loại chẩn đoán và phân nhóm phản ánh đầy đủ thực tế - vấn đề tình dục nữ giới ".[33]